Beta5が出ています。バグ修正と、ロトスコープとイメージクリップの改良が主です。
マルチスレッド対応の状況は
http://migrate.hash.com/forums/index.php?showtopic=28078
のようになってるらしいです。
マルチスレッドONにするとOFFより遅くて実用にならないのですが、
小さい画像でレイトレースシャドウ無しの時のみ高速に計算される、
というので正しいようです。
Hash氏ががんばって開発しているらしいですが、
マルチスレッド対応が実用可能になるまではまだ相当な時間がかかるみたいです。
時間がかかってもいいから実用的なマルチスレッド化をして欲しいです。
しばらくは今までと同じように2個同時起動でしのぐしかないです。
ネットレンダーのスレイブにシングルコアのCPUしか使えないのは痛いですが。

>表面的なエラーはないものの、怪しげなイベント音が『ﾎﾟｰﾝ』。

アニマスの場合、ファイル処理自体を完全には信頼できない物だと考えた方がいいです。
単純なロードやセーブも、いつ、どのバージョンからおかしくなるか分かりません。
まあ、ファイル処理だけでなく、アニマス全体においてそんな感じなのですが。